保護角度來說，建議兩種都申請，因保護內(nèi)容不同。專利保護軟件的內(nèi)部邏輯構(gòu)架（發(fā)明構(gòu)思），軟著保護的是代碼和說明文檔所展示的界面（發(fā)明構(gòu)思的一種表達(dá)方式）。

從申請難度來說，軟著屬于登記制，容易很多，價格低，周期也短。發(fā)明一般要2-3年的時間才能審查完，且要在技術(shù)方案上符合新穎性、創(chuàng)造性等要求才給授權(quán)，價格也相對較高 。

含金量來說，發(fā)明是最高的，以往的高新評定，一個授權(quán)發(fā)明相當(dāng)于6個實用新型或者6個軟著。具體可咨詢賦翼網(wǎng)，專業(yè)知識產(chǎn)權(quán)機構(gòu)。